Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Snx25Q3ZT31 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Snx25Q3ZT31 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Snx25Q3ZT31 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Snx25Q3ZT31 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,96■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25,96■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,75
Snx25Q3ZT31 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25,92■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Snx25Q3ZT31 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Snx25Q3ZT31 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Snx25Q3ZT31 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Snx25Q3ZT31 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Snx25Q3ZT31 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Snx25Q3ZT31 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Snx25Q3ZT31 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Snx25Q3ZT31 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Snx25Q3ZT31 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Snx25Q3ZT31 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Snx25Q3ZT31 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Snx25Q3ZT31 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Snx25Q3ZT31 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Snx25Q3ZT31 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Snx25Q3ZT31 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Snx25Q3ZT31 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Snx25Q3ZT31 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Snx25Q3ZT31 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Snx25Q3ZT31 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
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