Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itga1Q3V3R4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itga1Q3V3R4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itga1Q3V3R4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Itga1Q3V3R4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Itga1Q3V3R4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Itga1Q3V3R4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itga1Q3V3R4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms