Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R1

Mthfd1l, Monofunctional C1-tetrahydrofolate synthase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mthfd1lQ3V3R1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mthfd1lQ3V3R1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mthfd1lQ3V3R1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mthfd1lQ3V3R1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mthfd1lQ3V3R1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mthfd1lQ3V3R1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mthfd1lQ3V3R1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mthfd1lQ3V3R1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mthfd1lQ3V3R1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mthfd1lQ3V3R1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mthfd1lQ3V3R1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms