Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc110Q3V125 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc110Q3V125 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc110Q3V125 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc110Q3V125 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc110Q3V125 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc110Q3V125 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc110Q3V125 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms