Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X2

Cldn34b4, 4930428D18Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b4Q3V0X2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cldn34b4Q3V0X2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cldn34b4Q3V0X2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cldn34b4Q3V0X2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cldn34b4Q3V0X2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cldn34b4Q3V0X2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cldn34b4Q3V0X2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms