Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd53Q3V0J4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ankrd53Q3V0J4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd53Q3V0J4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd53Q3V0J4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ankrd53Q3V0J4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ankrd53Q3V0J4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms