Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ttc9Q3V038 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ttc9Q3V038 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ttc9Q3V038 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc9Q3V038 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ttc9Q3V038 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc9Q3V038 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc9Q3V038 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ttc9Q3V038 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc9Q3V038 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc9Q3V038 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ttc9Q3V038 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ttc9Q3V038 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ttc9Q3V038 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ttc9Q3V038 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ttc9Q3V038 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc9Q3V038 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc9Q3V038 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ttc9Q3V038 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms