Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm27235Q3UW50 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm27235Q3UW50 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm27235Q3UW50 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm27235Q3UW50 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm27235Q3UW50 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27235Q3UW50 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm27235Q3UW50 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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