Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Gm28047Q3US59 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Gm28047Q3US59 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm28047Q3US59 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gm28047Q3US59 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm28047Q3US59 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm28047Q3US59 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm28047Q3US59 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms