Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TceancQ3US16 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TceancQ3US16 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TceancQ3US16 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TceancQ3US16 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TceancQ3US16 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TceancQ3US16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TceancQ3US16 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TceancQ3US16 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TceancQ3US16 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TceancQ3US16 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TceancQ3US16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TceancQ3US16 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TceancQ3US16 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TceancQ3US16 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TceancQ3US16 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TceancQ3US16 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms