Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Skap2Q3UND0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Skap2Q3UND0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Skap2Q3UND0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Skap2Q3UND0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Skap2Q3UND0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Skap2Q3UND0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms