Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E330014E10RikQ3UL33 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E330014E10RikQ3UL33 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
E330014E10RikQ3UL33 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
E330014E10RikQ3UL33 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
E330014E10RikQ3UL33 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
E330014E10RikQ3UL33 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms