Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ceacam12Q3UKP4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ceacam12Q3UKP4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ceacam12Q3UKP4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ceacam12Q3UKP4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms