Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lmod2Q3UHZ5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Lmod2Q3UHZ5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Lmod2Q3UHZ5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Lmod2Q3UHZ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Lmod2Q3UHZ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Lmod2Q3UHZ5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Lmod2Q3UHZ5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Lmod2Q3UHZ5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Lmod2Q3UHZ5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Lmod2Q3UHZ5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Lmod2Q3UHZ5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Lmod2Q3UHZ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Lmod2Q3UHZ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Lmod2Q3UHZ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Lmod2Q3UHZ5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Lmod2Q3UHZ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Lmod2Q3UHZ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Lmod2Q3UHZ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Lmod2Q3UHZ5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Lmod2Q3UHZ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Lmod2Q3UHZ5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Lmod2Q3UHZ5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Lmod2Q3UHZ5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Lmod2Q3UHZ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Lmod2Q3UHZ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
Lmod2Q3UHZ5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Lmod2Q3UHZ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Lmod2Q3UHZ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Lmod2Q3UHZ5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Lmod2Q3UHZ5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Lmod2Q3UHZ5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
Lmod2Q3UHZ5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Lmod2Q3UHZ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Lmod2Q3UHZ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.49
Lmod2Q3UHZ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Lmod2Q3UHZ5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Lmod2Q3UHZ5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Lmod2Q3UHZ5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Lmod2Q3UHZ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Lmod2Q3UHZ5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Lmod2Q3UHZ5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Lmod2Q3UHZ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Lmod2Q3UHZ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Lmod2Q3UHZ5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Lmod2Q3UHZ5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Lmod2Q3UHZ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lmod2Q3UHZ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lmod2Q3UHZ5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lmod2Q3UHZ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Lmod2Q3UHZ5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lmod2Q3UHZ5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lmod2Q3UHZ5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lmod2Q3UHZ5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Lmod2Q3UHZ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lmod2Q3UHZ5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lmod2Q3UHZ5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lmod2Q3UHZ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Lmod2Q3UHZ5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Lmod2Q3UHZ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Lmod2Q3UHZ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms