Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Greb1Q3UHK3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Greb1Q3UHK3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Greb1Q3UHK3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Greb1Q3UHK3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Greb1Q3UHK3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Greb1Q3UHK3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Greb1Q3UHK3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms