Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rsph3aQ3UFY4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rsph3aQ3UFY4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rsph3aQ3UFY4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Rsph3aQ3UFY4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rsph3aQ3UFY4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rsph3aQ3UFY4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rsph3aQ3UFY4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms