Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trafd1Q3UDK1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trafd1Q3UDK1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trafd1Q3UDK1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trafd1Q3UDK1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trafd1Q3UDK1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trafd1Q3UDK1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.3 ms