Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5Q7

Cmpk2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk2Q3U5Q7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmpk2Q3U5Q7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cmpk2Q3U5Q7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmpk2Q3U5Q7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmpk2Q3U5Q7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmpk2Q3U5Q7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmpk2Q3U5Q7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmpk2Q3U5Q7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmpk2Q3U5Q7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cmpk2Q3U5Q7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmpk2Q3U5Q7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmpk2Q3U5Q7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmpk2Q3U5Q7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmpk2Q3U5Q7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmpk2Q3U5Q7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmpk2Q3U5Q7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmpk2Q3U5Q7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmpk2Q3U5Q7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms