Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hectd3Q3U487 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hectd3Q3U487 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hectd3Q3U487 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hectd3Q3U487 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hectd3Q3U487 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hectd3Q3U487 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms