Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ulk3Q3U3Q1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ulk3Q3U3Q1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ulk3Q3U3Q1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ulk3Q3U3Q1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ulk3Q3U3Q1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ulk3Q3U3Q1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ulk3Q3U3Q1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ulk3Q3U3Q1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk3Q3U3Q1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ulk3Q3U3Q1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk3Q3U3Q1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk3Q3U3Q1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk3Q3U3Q1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk3Q3U3Q1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ulk3Q3U3Q1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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