Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Hvcn1Q3U2S8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Hvcn1Q3U2S8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hvcn1Q3U2S8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hvcn1Q3U2S8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hvcn1Q3U2S8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hvcn1Q3U2S8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180 ms