Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tatdn3Q3U1C6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tatdn3Q3U1C6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tatdn3Q3U1C6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tatdn3Q3U1C6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tatdn3Q3U1C6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tatdn3Q3U1C6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tatdn3Q3U1C6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tatdn3Q3U1C6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tatdn3Q3U1C6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tatdn3Q3U1C6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms