Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms