Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Hace1Q3U0D9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Hace1Q3U0D9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Hace1Q3U0D9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hace1Q3U0D9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hace1Q3U0D9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hace1Q3U0D9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hace1Q3U0D9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hace1Q3U0D9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms