Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ89

Sec31b, Protein transport protein Sec31B, mousemouse

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31bQ3TZ89 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec31bQ3TZ89 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec31bQ3TZ89 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sec31bQ3TZ89 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec31bQ3TZ89 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec31bQ3TZ89 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec31bQ3TZ89 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sec31bQ3TZ89 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sec31bQ3TZ89 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec31bQ3TZ89 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec31bQ3TZ89 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec31bQ3TZ89 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec31bQ3TZ89 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sec31bQ3TZ89 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec31bQ3TZ89 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec31bQ3TZ89 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec31bQ3TZ89 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sec31bQ3TZ89 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms