Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2afvQ3THW5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
H2afvQ3THW5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
H2afvQ3THW5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2afvQ3THW5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2afvQ3THW5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2afvQ3THW5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
H2afvQ3THW5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
H2afvQ3THW5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
H2afvQ3THW5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H2afvQ3THW5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H2afvQ3THW5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H2afvQ3THW5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H2afvQ3THW5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2afvQ3THW5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2afvQ3THW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afvQ3THW5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afvQ3THW5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afvQ3THW5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afvQ3THW5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2afvQ3THW5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2afvQ3THW5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2afvQ3THW5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms