Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc69Q3TCJ8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc69Q3TCJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc69Q3TCJ8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms