Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC46

Patl1, Protein PAT1 homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl1Q3TC46 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Patl1Q3TC46 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Patl1Q3TC46 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Patl1Q3TC46 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Patl1Q3TC46 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Patl1Q3TC46 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.3 ms