Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc127Q3TC33 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc127Q3TC33 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc127Q3TC33 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccdc127Q3TC33 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc127Q3TC33 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc127Q3TC33 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc127Q3TC33 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc127Q3TC33 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms