Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Jmjd8Q3TA59 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Jmjd8Q3TA59 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Jmjd8Q3TA59 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Jmjd8Q3TA59 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms