Protein–RNA interactions for Protein: Q32KG4

Rtl9, Retrotransposon Gag-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl9Q32KG4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtl9Q32KG4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rtl9Q32KG4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rtl9Q32KG4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl9Q32KG4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rtl9Q32KG4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl9Q32KG4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rtl9Q32KG4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl9Q32KG4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl9Q32KG4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl9Q32KG4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rtl9Q32KG4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rtl9Q32KG4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl9Q32KG4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl9Q32KG4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl9Q32KG4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl9Q32KG4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl9Q32KG4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl9Q32KG4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl9Q32KG4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl9Q32KG4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl9Q32KG4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl9Q32KG4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rtl9Q32KG4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rtl9Q32KG4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms