Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPA6

Helq, Helicase POLQ-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelqQ2VPA6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HelqQ2VPA6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HelqQ2VPA6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HelqQ2VPA6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HelqQ2VPA6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HelqQ2VPA6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HelqQ2VPA6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HelqQ2VPA6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms