Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spatc1Q148B6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spatc1Q148B6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spatc1Q148B6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Spatc1Q148B6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Spatc1Q148B6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Spatc1Q148B6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spatc1Q148B6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.6 ms