Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Atp2b3Q0VF55 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Atp2b3Q0VF55 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Atp2b3Q0VF55 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Atp2b3Q0VF55 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Atp2b3Q0VF55 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Atp2b3Q0VF55 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Atp2b3Q0VF55 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Atp2b3Q0VF55 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Atp2b3Q0VF55 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms