Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL6

Hif3a, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif3aQ0VBL6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Hif3aQ0VBL6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Hif3aQ0VBL6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Hif3aQ0VBL6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hif3aQ0VBL6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hif3aQ0VBL6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hif3aQ0VBL6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms