Protein–RNA interactions for Protein: Q0P547

Vmn1r181, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r181Q0P547 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r181Q0P547 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn1r181Q0P547 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn1r181Q0P547 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn1r181Q0P547 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn1r181Q0P547 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r181Q0P547 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Vmn1r181Q0P547 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Vmn1r181Q0P547 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r181Q0P547 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmn1r181Q0P547 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r181Q0P547 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Vmn1r181Q0P547 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmn1r181Q0P547 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmn1r181Q0P547 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r181Q0P547 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r181Q0P547 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r181Q0P547 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Vmn1r181Q0P547 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms