Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Znf541Q0GGX2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Znf541Q0GGX2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Znf541Q0GGX2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Znf541Q0GGX2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Znf541Q0GGX2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Znf541Q0GGX2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Znf541Q0GGX2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Znf541Q0GGX2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Znf541Q0GGX2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Znf541Q0GGX2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
Znf541Q0GGX2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Znf541Q0GGX2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Znf541Q0GGX2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Znf541Q0GGX2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Znf541Q0GGX2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Znf541Q0GGX2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Znf541Q0GGX2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Znf541Q0GGX2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
Znf541Q0GGX2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Znf541Q0GGX2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Znf541Q0GGX2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Znf541Q0GGX2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Znf541Q0GGX2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Znf541Q0GGX2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Znf541Q0GGX2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Znf541Q0GGX2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Znf541Q0GGX2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Znf541Q0GGX2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Znf541Q0GGX2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Znf541Q0GGX2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Znf541Q0GGX2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Znf541Q0GGX2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Znf541Q0GGX2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Znf541Q0GGX2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Znf541Q0GGX2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Znf541Q0GGX2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Znf541Q0GGX2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Znf541Q0GGX2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Znf541Q0GGX2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Znf541Q0GGX2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Znf541Q0GGX2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms