Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cntn3Q07409 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cntn3Q07409 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cntn3Q07409 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cntn3Q07409 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cntn3Q07409 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cntn3Q07409 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cntn3Q07409 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms