Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Apoc2Q05020 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apoc2Q05020 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Apoc2Q05020 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Apoc2Q05020 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Apoc2Q05020 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Apoc2Q05020 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms