Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Sox12Q04890 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sox12Q04890 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sox12Q04890 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Sox12Q04890 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Sox12Q04890 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sox12Q04890 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sox12Q04890 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Sox12Q04890 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sox12Q04890 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sox12Q04890 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Sox12Q04890 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sox12Q04890 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sox12Q04890 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sox12Q04890 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sox12Q04890 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sox12Q04890 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Sox12Q04890 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sox12Q04890 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sox12Q04890 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Sox12Q04890 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Sox12Q04890 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sox12Q04890 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Sox12Q04890 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sox12Q04890 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Sox12Q04890 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Sox12Q04890 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Sox12Q04890 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
Sox12Q04890 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sox12Q04890 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Sox12Q04890 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sox12Q04890 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sox12Q04890 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sox12Q04890 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sox12Q04890 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Sox12Q04890 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sox12Q04890 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Sox12Q04890 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sox12Q04890 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms