Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sox10Q04888 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sox10Q04888 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sox10Q04888 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sox10Q04888 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Sox10Q04888 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Sox10Q04888 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sox10Q04888 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sox10Q04888 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Sox10Q04888 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Sox10Q04888 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sox10Q04888 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sox10Q04888 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sox10Q04888 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sox10Q04888 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms