Protein–RNA interactions for Protein: Q02614

Sap30bp, SAP30-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30bpQ02614 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Sap30bpQ02614 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sap30bpQ02614 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sap30bpQ02614 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sap30bpQ02614 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sap30bpQ02614 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sap30bpQ02614 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Sap30bpQ02614 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sap30bpQ02614 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sap30bpQ02614 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Sap30bpQ02614 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sap30bpQ02614 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sap30bpQ02614 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sap30bpQ02614 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sap30bpQ02614 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Sap30bpQ02614 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sap30bpQ02614 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sap30bpQ02614 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Sap30bpQ02614 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sap30bpQ02614 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sap30bpQ02614 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sap30bpQ02614 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sap30bpQ02614 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sap30bpQ02614 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sap30bpQ02614 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sap30bpQ02614 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Sap30bpQ02614 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sap30bpQ02614 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sap30bpQ02614 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sap30bpQ02614 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sap30bpQ02614 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sap30bpQ02614 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sap30bpQ02614 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms