Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JupQ02257 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JupQ02257 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JupQ02257 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JupQ02257 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JupQ02257 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JupQ02257 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JupQ02257 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JupQ02257 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
JupQ02257 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
JupQ02257 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JupQ02257 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JupQ02257 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
JupQ02257 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JupQ02257 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
JupQ02257 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
JupQ02257 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
JupQ02257 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JupQ02257 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JupQ02257 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
JupQ02257 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
JupQ02257 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JupQ02257 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JupQ02257 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JupQ02257 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JupQ02257 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JupQ02257 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JupQ02257 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JupQ02257 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
JupQ02257 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
JupQ02257 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
JupQ02257 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
JupQ02257 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
JupQ02257 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JupQ02257 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JupQ02257 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JupQ02257 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
JupQ02257 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JupQ02257 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JupQ02257 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JupQ02257 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JupQ02257 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
JupQ02257 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
JupQ02257 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JupQ02257 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JupQ02257 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JupQ02257 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JupQ02257 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JupQ02257 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JupQ02257 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JupQ02257 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
JupQ02257 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JupQ02257 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
JupQ02257 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
JupQ02257 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JupQ02257 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
JupQ02257 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
JupQ02257 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JupQ02257 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JupQ02257 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
JupQ02257 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JupQ02257 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
JupQ02257 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
JupQ02257 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
JupQ02257 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
JupQ02257 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JupQ02257 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JupQ02257 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
JupQ02257 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JupQ02257 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JupQ02257 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JupQ02257 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JupQ02257 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
JupQ02257 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
JupQ02257 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
JupQ02257 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
JupQ02257 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
JupQ02257 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JupQ02257 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JupQ02257 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
JupQ02257 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
JupQ02257 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
JupQ02257 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
JupQ02257 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JupQ02257 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JupQ02257 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JupQ02257 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JupQ02257 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
JupQ02257 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
JupQ02257 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
JupQ02257 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
JupQ02257 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
JupQ02257 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
JupQ02257 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
JupQ02257 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
JupQ02257 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JupQ02257 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JupQ02257 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
JupQ02257 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
JupQ02257 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms