Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gabpb1Q00420 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Gabpb1Q00420 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gabpb1Q00420 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gabpb1Q00420 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gabpb1Q00420 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gabpb1Q00420 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms