Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Flt3Q00342 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Flt3Q00342 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Flt3Q00342 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Flt3Q00342 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Flt3Q00342 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Flt3Q00342 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms