Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cited1P97769 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited1P97769 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cited1P97769 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited1P97769 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cited1P97769 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited1P97769 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited1P97769 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cited1P97769 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cited1P97769 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited1P97769 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cited1P97769 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cited1P97769 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cited1P97769 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms