Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
rp9P97762 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
rp9P97762 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
rp9P97762 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
rp9P97762 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
rp9P97762 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
rp9P97762 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
rp9P97762 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
rp9P97762 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
rp9P97762 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
rp9P97762 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
rp9P97762 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
rp9P97762 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
rp9P97762 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
rp9P97762 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
rp9P97762 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
rp9P97762 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
rp9P97762 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
rp9P97762 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
rp9P97762 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
rp9P97762 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
rp9P97762 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
rp9P97762 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
rp9P97762 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
rp9P97762 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
rp9P97762 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
rp9P97762 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
rp9P97762 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
rp9P97762 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
rp9P97762 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
rp9P97762 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
rp9P97762 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
rp9P97762 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
rp9P97762 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
rp9P97762 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
rp9P97762 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
rp9P97762 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
rp9P97762 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
rp9P97762 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
rp9P97762 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
rp9P97762 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
rp9P97762 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
rp9P97762 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
rp9P97762 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
rp9P97762 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
rp9P97762 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
rp9P97762 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
rp9P97762 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
rp9P97762 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
rp9P97762 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
rp9P97762 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
rp9P97762 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
rp9P97762 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
rp9P97762 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
rp9P97762 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
rp9P97762 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
rp9P97762 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
rp9P97762 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
rp9P97762 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
rp9P97762 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
rp9P97762 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
rp9P97762 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
rp9P97762 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
rp9P97762 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
rp9P97762 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
rp9P97762 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
rp9P97762 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
rp9P97762 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
rp9P97762 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
rp9P97762 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
rp9P97762 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
rp9P97762 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
rp9P97762 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
rp9P97762 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
rp9P97762 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
rp9P97762 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
rp9P97762 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
rp9P97762 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
rp9P97762 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
rp9P97762 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
rp9P97762 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
rp9P97762 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
rp9P97762 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
rp9P97762 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
rp9P97762 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
rp9P97762 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
rp9P97762 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
rp9P97762 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
rp9P97762 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
rp9P97762 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
rp9P97762 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
rp9P97762 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
rp9P97762 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
rp9P97762 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
rp9P97762 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
rp9P97762 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
rp9P97762 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
rp9P97762 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
rp9P97762 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
rp9P97762 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms