Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nkx3-2P97503 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nkx3-2P97503 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx3-2P97503 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx3-2P97503 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx3-2P97503 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx3-2P97503 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx3-2P97503 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx3-2P97503 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx3-2P97503 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx3-2P97503 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx3-2P97503 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx3-2P97503 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx3-2P97503 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms