Protein–RNA interactions for Protein: P97427

Crmp1, Dihydropyrimidinase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crmp1P97427 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Crmp1P97427 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Crmp1P97427 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Crmp1P97427 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Crmp1P97427 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crmp1P97427 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crmp1P97427 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Crmp1P97427 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Crmp1P97427 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Crmp1P97427 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crmp1P97427 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Crmp1P97427 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Crmp1P97427 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Crmp1P97427 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Crmp1P97427 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Crmp1P97427 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Crmp1P97427 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Crmp1P97427 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms