Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43bP86448 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43bP86448 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim43bP86448 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trim43bP86448 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim43bP86448 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trim43bP86448 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim43bP86448 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim43bP86448 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 232.2 ms