Protein–RNA interactions for Protein: P86050

Tmem170b, Transmembrane protein 170B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem170bP86050 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem170bP86050 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem170bP86050 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem170bP86050 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem170bP86050 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem170bP86050 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem170bP86050 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem170bP86050 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem170bP86050 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem170bP86050 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmem170bP86050 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmem170bP86050 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tmem170bP86050 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem170bP86050 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms